新战国时代，忍者们展开着与魔鬼们剧烈的战役。以战役结尾，猿飞佐助为首的5人的忍者们，在自无敌将军们三神将被给予的「封印的门」中关锁魔鬼总司令和魔鬼们的能源的，事上成功了。丢掉能源并在人类社会融洽了的魔鬼カッパは，欺诳猿飞佐助的子孙佐助和雾隐的子孙才躲，使之开了东京湾有了的封印的门。凝视了祖先世世代代封印的门的血缘的少女…